唐末產生的內丹與符籙相結合的新的符籙道派，也是唐宋間融道教諸派精華新構成的重要道派。該派以其符法出於清微元始天尊，故名。據《清微仙譜》載：清微雷法由元始天尊所降，其後列有上清、靈寶、道德、正一諸宗道君高真，稱「會道」於唐末廣西零陵人祖舒祖元君，經郭玉隆、傅央焴、姚莊、高奭、華英、朱洞元、李少微、南畢道，傳至碧水雷匝真人黃舜申。祖舒遂成為清微派的實際創始人。《清微齋法》說朱洞元、李少微、南畢道都隱於青城山。南畢道將清微雷法授黃舜申，黃以擅雷法而聞名京師，宋理宗召見，書「雷阻真人」四字以贈，至元代又授其「真人」號，清微道教至此始大顯於世。《清微仙譜》：「先生門弟幾百餘人，今清微道法大行於世，然得其樞奧闡揚」。在其門徒中，有西山熊真息一支，傳行於南，後傳至濬儀趙宜真；另有張道貴一支，以武當為傳播中心，開武當清微派。清微派和神霄、淨明相近，皆以融合內丹修煉與符法外用為特徵，主張內煉為本，道法為用。重視自身內在的修煉，發明保養自身的真一之炁，即一點靈光，達到通變之神妙。並傳有《清微丹訣》行世，述丹、法之旨義。認為只要萬法具於一心，心若寂然不動，得太極之體，自然有感即通。宋元以後，清微派實已融為正一道的主要道派，在北京白雲觀所藏《諸真宗派總簿》中所列清微派有九支之多，其中有清微派目、有三茅真君各傳的清微派、有正一天師清微派。《東嶽廟志•靈濟先祠神牌表》還祠列有自明代一至十五代的清微祖師宗譜。至今，清微道法仍廣為流傳。在《道藏》中收錄清微派道書主要有《清微仙譜》、《清微丹訣》、《清微齋法》、《清微神烈秘法》、《清微元降大法》等，《道法會元》中並收有清微雷法多種。