(1)喻上丹田，即腦神所居之處。《三十代天師虛靖真君語錄》卷三《橐籥歌》：「兩條直上上丹田，決言上有三清閣，閣下分明有玉池，內有長生不死藥」。

(2)宮觀殿堂名，一般大道觀都建有三清殿或三清閣，內供奉道教最高尊神三清(元始天尊、靈寶天尊、道德天尊)。也有建造二層樓閣殿堂，下層供奉四御，上層供奉三清，故名三清閣。