(1)外丹名詞。指用靈砂及草藥，通過一定程序及配方，合制而成之服用丸藥。《洞真太上道君元丹上經》：「夫欲合藥，凡藥者合之，皆先齋戒清潔，藥成則有驗，名之為玄丹」。

(2)傳說中的仙山名。《山海經•大荒西經》「有玄丹之山」注：「山黑丹也」。

(3)指心之神。《雲笈七籤》卷十一《黃庭內景經•若得》：「若得三宮存玄丹」。注：「玄丹、丹元，謂心也」。

(4)指構成胎兒的陽氣。《無上秘要》卷五《人品》：「故人象天地，氣法自然。自然之氣，皆是九天之精化為人身，含胎育養……何由得存，陽氣赤，名曰玄丹；陰氣黃，名曰黃精。陰陽既交，二氣降精，化神結胎」。